A Nave dos Cordeiros é uma estrutura cársica de tipo polje, depressão alongada simétrica com cerca de 5 km de extensão, alinhada com a Nave do Barão ao longo de uma  fratura Este-Oeste e separada por uma pequena elevação, denominada de portela. Esta nave desenvolveu-se em calcários e dolomitos do Jurássico Inferior, o seu  fundo estando coberto por coluviões e terra-rossa, que permitem a formação de charcos temporários no período de chuva. Nas povoações de Nave dos Cordeiros e Charneca da Nave é também possível encontrar relevos residuais formados por calcários oolíticos. A nave é atravessada pela ribeira de Alte, que nasce na Fonte Grada e deságua na Vala Grande. Em invernos muito chuvosos, o fundo da nave pode igualmente ficar coberto de água proveniente de nascentes do fundo ou das vertentes, devido à subida do nível freático.