Em vales cegos e zonas planas cársicas, localizam-se alguns charcos temporários de cariz mediterrânico. Estas depressões pouco profundas apresentam uma alternância inter-anual entre uma fase seca e uma fase inundada, com a particularidade de estarem conectados com águas subterrâneas, tornando assim mais prolongado o período em que há armazenamento de água nos charcos.
No início da primavera, podemos observar as plantas aquáticas flutuantes e.g. ranúnculo-aquático (Ranunculus peltatus), com as folhas e flores à superfície. Sucedem-se as plantas anfíbias (e.g. Eleocharis palustris, Illecebrum verticillatum), que começam o seu desenvolvimento vegetativo ainda submersas e florescem apenas quando a água começa a desaparecer, persistindo até à chegada da fase seca (início do verão).
Quanto à fauna, os charcos temporários servem de zona de alimentação e de reprodução a várias espécies de aves como o solitário (Cercotrichas galactotes), o peneireiro-cinzento (Elanus caeruleus) ou o chasco-ruivo (Oenanthe hispanica), a várias espécies de anfíbios como o tritão-pigmeu (Triturus pygmaeus), o sapinho-de-verrugas-verdes (Pelodytes ibericus sp.) ou a rela-meridional (Hyla meridionalis) e a invertebrados como por exemplo a libélula-escarlate (Crocothemis erythraea), a libélula-púrpura (Thrithemis annulata) ou o tira-olhos-imperador (Anax imperator), a maior libélula da fauna portuguesa, sendo cruciais para a existência de algumas espécies pouco comuns e com elevado valor de conservação.
Das espécies que habitam estes charcos, destaca-se a mais emblemática: o Triops vicentinus, uma espécie de camarão, da classe dos branquiópodes, identificado pela primeira vez em 2010, nos charcos temporários de água doce do concelho de Vila do Bispo, e que também conta com algumas observações ocasionais no território do Geoparque, nomeadamente na zona de Tunes e Paderne. Estes organismos são conhecidos como fósseis vivos porque existem há mais de 200 milhões de anos. São crustáceos de água doce temporária designados de "camarões-girino", como traduzido do inglês “tadpole shrimps”.